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原本中医系毕业的张机，因为中医不容乐观的就业情势，于是打算转行“更有前途”的西医。然而某天他回家后，发现家中多了位不速之客——医仙【岐伯】。岐伯以“因为你是张机（张仲景）”为理由，将“重振中医”交给了张机。 为了让张机可以胜任“重振中医”的重任，岐伯遣药灵亲自教导张机中药的配伍使用，并将一本可以与药灵订立契约的《玉函本草集》交由张机，同时让人参【任弦】作为张机的帮助与监督者。

我自虚空而来，举手诸天崩碎，覆手黄泉寂灭；我为魔、为神、为仙、为人。我是萧晨，也是万物，亦为主宰！

这个世界上有着许多从远古流传下来的“裂缝”，这些裂缝是人界与灵界之间的通道。普通的人类并不具备看到或通过裂缝的能力，但裂缝那边的精灵可以。 于是在几百年前，为了保持两界平衡，人界出现了一个叫裂缝管理者的家族，他们的任务就是封印裂缝、驱逐精灵。